Peptidsalter: TFA eller acetat – vad betyder det för dina försök?
Syntetiska peptider är sällan helt "rena" i betydelsen enbart peptid. De innehåller också motjoner, och vilken sort som finns spelar roll i vissa försök.
Varför TFA?
Vid fastfassyntes och rening används ofta trifluorättiksyra (TFA). Efter rening sitter därför TFA kvar som motjon till de positivt laddade grupperna i peptiden. Resultatet kallas TFA-salt.
Acetat som alternativ
Motjonen kan bytas till acetat, vilket ofta ses som mer skonsamt i biologiska försök. Byte sker genom jonbyte eller en extra reningsprocess, vilket gör produkten dyrare.
Varför spelar det roll?
- Cellförsök. Rester av TFA kan påverka cellers tillväxt och resultat i vissa känsliga analyser.
- Vikt och mängd. Motjoner och vatten väger också. Därför är peptidhalten lägre än total vikt, se mg och nettoinnehåll.
- Löslighet. Saltformen kan påverka hur peptiden löser sig.
Vad du bör fråga leverantören
- Vilken saltform har peptiden?
- Anges peptidhalten, eller bara bruttovikt?
- Finns det dokumentation i COA:t? Se så läser du ett COA.
För många försök är saltformen inte avgörande, men om du arbetar med celler eller väldigt känsliga mätningar är det en detalj värd att ta reda på. Mer om hur peptider tillverkas finns i peptidsyntes.
